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點擊次數(shù):17285 發(fā)布時間:2012/9/18 15:30:01
:plko.1-trc克隆載體
財團的干擾
1的plko。克隆載體骨干,技術(shù)聯(lián)盟(券)建了一個圖書館的發(fā)夾針對15000人和15000小鼠基因。addgene正與真相與和解委員會使這個狀克隆載體提供給科學界。請舉北陸等人。,2006月;124(6):1283-98(醫(yī)學)在所有出版物引起使用這種載體。
1 plko數(shù)碼地圖。
plko。1是一個不稱職的慢病毒載體選擇的真相與和解委員會表達發(fā)夾。plko。1可引入細胞通過直接轉(zhuǎn)染,或可轉(zhuǎn)換成慢粒子隨后感染的靶細胞系。一經(jīng)推出,嘌呤霉素抗性標記編碼plko 1允許方便穩(wěn)定的選擇。
圖1:圖1 plko含有狀插入。原plko.1-trc克隆載體有一1.9kb填充物是由消化上井和限制性。狀核苷酸克隆到上井和限制性網(wǎng)站中的填充物。在上井現(xiàn)場銷毀在大多數(shù)情況下(取決于靶序列),而限制性網(wǎng)站保存。一個完整的地圖plko。1載1.9kb填塞,訪問www.addgene.org/10878。
描述向量元素
U 6人U 6啟動子驅(qū)動聚合酶轉(zhuǎn)錄三代狀記錄。
cppt中央polypurine道,cppt,改善傳導效率,促進核進口的載體”的國家的復雜的細胞的轉(zhuǎn)。
hpgk人力磷酸激酶啟動子驅(qū)動表達嘌呤。
嘌呤霉素抗性基因選擇是選擇plko 1質(zhì)粒在哺乳動物細胞中。
3 ''ltr 3 ' '鈍長末端重復。
F1山F1細菌復制的起源。
安培的氨芐青霉素抗性基因選擇plko 1質(zhì)粒在細菌細胞。
市局山市局細菌復制的起源。
5 ''ltr 5 '長末端重復。
債轉(zhuǎn)速反應元件。
圖2:細節(jié)狀插入。該U 6啟動子指導核糖核酸轉(zhuǎn)錄聚合酶三狀。狀包含21個“意義”的基礎是相同的目標基因,一個環(huán)包含一個xhoi限制的網(wǎng)站,和21的“反”的基礎,是相輔相成的“意義”基地。狀其次是polyt終止序列聚合酶三。
. 3的相關(guān)產(chǎn)品
以下質(zhì)粒可從addgene建議使用與plko 1 trc-cloning向量。
質(zhì)粒(addgene身份#)描述
plko。1 -真相與和解委員會的控制(10879)陰性對照載體插入發(fā)夾。
plko。1 -爭奪狀(1864)陰性對照載體炒狀。
pspax2(12260)包裝質(zhì)粒生產(chǎn)病毒顆粒。
pmd2。克(12259)信封質(zhì)粒生產(chǎn)病毒顆粒。
注:plko。1也可以用來與包裝質(zhì)粒和pcmv-dr8.2(addgene # 8455)和包膜質(zhì)粒pcmv-vsvg(addgene # 8454)從羅伯特溫伯格的實驗室。更多信息,訪問addgene '的哺乳動物干擾工具頁。
其他幾個實驗室已經(jīng)plko衍生載體,也可能是有用的實驗。看到這些載體,訪問addgene '的網(wǎng)站和搜索”plko”。
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B .設計為1 plko狀寡核苷酸。
B . 1確定*佳21濱海目標在你的基因
選擇合適的21濱海目標基因的步是有效的基因沉默。方法選擇目標的不斷提高。以下是建議為目標的選擇。
1。使用中的選擇工具來確定一組得分的目標,你的基因。例如,懷特海生物醫(yī)學研究所主辦了一個基因選擇程序,可以訪問后,免費注冊(網(wǎng)址:/ /侏羅。我。麻省理工學院。”/ bioc / sirnaext /)。如果你有機會,另一個很好的程序irnai,這是免費提供的公司mekentosj(網(wǎng)址:http : / / / www.mekentosj。irnai /)。
總結(jié)準則設計的siRNA與有效的基因沉默是包含在這里:
從25nt下游的起始密碼子(球蛋白),搜索21nt序列匹配模式機管局(n19)。如果沒有合適的匹配,搜索納爾(*新)ynn,沒有任何核苷酸,是嘌呤(一,克),并是一個嘧啶(丙,你)。
氣相色譜法的內(nèi)容應該是36-52 %。
3’端應具有較低的穩(wěn)定性–至少一一或之間的位置- 19。
避免針對內(nèi)含子。
避免的4個或多個核苷酸重復,尤其是因為重復polyt是終止信號的核糖核酸聚合酶三。
2。減少退化的目標基因,利用美國的高爐項目。選擇序列,至少有3個核苷酸錯配的所有基因無關(guān)。
addgene建議你選擇多目標序列為每個基因。一些序列將乙
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